Основная сложность в раздельном учете НДС. К этому нужно отнестись серьезно, потому что, если не организовать раздельный учет, принять НДС к вычету даже на общем режиме не получится.
Суммы НДС по товарам и услугам, которые приобретались для бизнеса на общем режиме принимаются к вычету в общем порядке. А НДС, относящийся к работе по патенту учитывается в стоимости товаров, работ и т.д.
Кроме того, у предпринимателя могут быть общие суммы НДС, которые относятся к деятельности на обоих режимах. Их нужно распределить пропорционально между ОСНО и ПСН, при этом отталкиваться нужно от выручки на каждом режиме.
Методика распределения должна быть закреплена в налоговой учетной политике.
Что касается страховых платежей, то по ним тоже нужно вести раздельный учет и распределять их между двумя режимами. При этом если на ОСНО взносы можно включить с расходы, то на ПСН такой возможности нет. Если взносы относятся к деятельности на обоих режимах, их распределяют пропорционально доходам.
У этих двух систем есть лимиты по выручке. Для УСН это 150 млн. в год, для ПСН – 60 млн. Применяя обе системы нужно ориентироваться на лимит в 60 млн. руб. для всех видов деятельности. Как только предприниматель заработает в сумме больше 60 миллионов в пределах одного года, право на патент он теряет.
Этот вопрос вызывает много споров и мнения чиновников расходятся. К примеру, есть письмо Минфина N 03-11-11/15437, в котором говорится, что можно нанимать до 100 сотрудников, но при этом следить, чтобы в патентной деятельности было занято не больше 15 человек. Но если заглянуть в чуть более позднее письмо Минфина N 03-11-09/41869, то позиция там совершенно противоположная: 15 человек максимум по всем видам деятельности.
Судебная практика на стороне налогоплательщиков, это подтверждает Определение Верховного Суда N 306-КГ16-4814.
Что касается доходов и расходов, то с их распределением сложностей возникнуть не должно, ведь предприниматель всегда знает, к какой деятельности они относятся. Общие затраты, которые невозможно разделить, распределяются пропорционально выручке.
Когда применяется УСН и патент одновременно, страховые взносы за себя предприниматель без сотрудников может полностью вычесть из упрощенного налога или включить в расходы, если применяет упрощенку с объектом «Доходы минус расходы».
Если есть сотрудники, то взносы за работников, занятых на упрощенке, тоже вычитаются из налога или включаются в расходы (в зависимости от объекта налогообложения). А вот взносы по персоналу, занятому в патентном бизнесе вычитать и включать в расходы нельзя.
Эти две системы налогообложения схожи тем, что на них переводится не сам предприниматель, а отдельный вид деятельности.
По максимальному количеству наемных сотрудников ситуация такая же спорная, как и в случае совмещение ПСН и УСН. Как всегда, в таких случаях рекомендуем узнать мнение местной налоговой.
По доходам лимит соблюдается только в части ПСН, у ЕНВД такого лимита нет.
Страховые платежи за себя ИП вычитает из вмененного налога. Взносы за работников учитываются отдельно и из вмененного налога вычитаются только платежи за сотрудников, занятых в бизнесе на вмененке, причем налог при этом можно уменьшить максимум наполовину.
Еще одна полезная деталь. Бывает, наемные работники есть, но все они заняты на ПСН. В этом случае все взносы за себя ИП может вычесть из вмененного налога без 50%-ого ограничения.
ИП, который изначально числится на ОСНО или УСН, может на один или несколько видов работ купить патент, а другой перевести на ЕНВД. Если при этом он ведет еще какую-то деятельность на общем режиме или упрощенке, то речь идет уже о совмещении трех систем налогообложения.
Статью подготовила руководитель отдела подбора персонала Толмачёва Диана Глебовна. 
