Если организация, помимо операций, облагаемых НДС, осуществляет операции, не подлежащие налогообложению (либо освобожденные от налогообложения), необходимо прописать в учетной политике порядок их раздельного учета (п.4 ст.149, абз.5 п.4 ст.170 НК РФ).
Несколько слов о том, зачем нужен раздельный учет. Раздельный учет НДС необходим, чтобы правильно рассчитать сумму НДС к уплате в бюджет.
Для правильного распределения сумм «входного» НДС между различными видами деятельности организация ведет раздельный учет:
• операций, облагаемых НДС;
• операций, освобожденных от налогообложения (включая операции, которые не являются объектом обложения НДС) в соответствии со ст.146 и 149 НК РФ.
Компании обязаны вести раздельный учет по НДС даже в том случае, если ими соблюдается правило пяти процентов (Федеральный закон №335-ФЗ). И если компанией не организован раздельный учет подобных операций, то компания не вправе заявлять налоговые вычеты (п.4 ст.170 НК РФ, Письмо Минфина РФ №03-07-11/61862, Постановления АС Уральского округа №А76-7964, Северо-Западного округа №А56-72196).
Глава 21 НК РФ и ст. 149 НК РФ не устанавливают способ ведения раздельного учета. В этой связи компания вправе выбрать способ, который позволял бы ей в целях применения льготы по пп.13 п.2 ст.149 НК РФ наиболее удобным образом определить, какая сумма входного НДС относится к налогооблагаемым операциям, а какая - к операциям, освобожденным от налогообложения.
«Входной» НДС можно принять к вычету в полном объеме (т.е. не распределяя) в случае, если доля расходов по операциям, освобожденным от налогообложения, не превышает 5 процентов от совокупных расходов по всем операциям. Данное правило работает при совершении покупок, которые предназначены одновременно и для облагаемых НДС, и для освобожденных от НДС операций.
Организация ведет раздельный учет в части операций, облагаемых НДС по ставке 18 (10) процентов и освобожденных от налогообложения.
Если прописанные в учетной политике по НДС способы ведения раздельного учета сумм «входного» НДС не соблюдаются, налоговики откажут в праве возмещения НДС (Постановление АС Дальневосточного округа №А04-8141).
Приведем фрагмент учетной политики в части раздельного учета НДС.
Для обеспечения раздельного учета НДС к 90 счетам открываются следующие субсчета:
• «Операции, облагаемые НДС»;
• «Операции, освобожденные от налогообложения».
Для обеспечения раздельного учета «входного» НДС к 19 счетам открываются следующие субсчета:
• «НДС к вычету»;
• «НДС к распределению».
1.1. «Входной» НДС по товарам, приобретенным только для деятельности, освобожденной от налогообложения, включаются в стоимость товаров без отражения на счете 19.
1.2. «Входной» НДС по товарам, приобретенным для деятельности, облагаемой НДС, отражается на счете 19 субсчет «НДС к вычету».
1.3. «Входной» НДС по товарам, приобретенным для деятельности, облагаемой НДС и для деятельности, освобожденной от налогообложения, отражается на счете 19 субсчет «НДС к распределению».
По итогам квартала «входной» НДС, отраженный на счете 19 субсчет «НДС к распределению», подлежит распределению по формуле:
НДС к вычету
=
Сумма НДС, предъявленная поставщиками (исполнителями) за отчетный квартал
×
Стоимость отгруженных за отчетный квартал товаров (работ, услуг), реализация которых облагается НДС
:
Общая стоимость товаров (работ, услуг), отгруженных за отчетный квартал
Сумма НДС, подлежащая включению в стоимость активов, определяется как разница между общей суммой НДС, предъявленной поставщиками за отчетный квартал и суммой НДС к вычету.
1.4. Сумма «входного» НДС, подлежащего включению в стоимость товаров, учитывается в себестоимости продаж пропорционально доле стоимости реализованных товаров в общей стоимости товаров, учтенных в квартале».
Статью подготовила специалист по международным стандартам финансовой отчетности Меликова Мария Марковна. 
